如何选择显微镜上的相机

发布时间:2020-12-11
目前市场上有许许多多的显微镜可供选择,单就相机而言,它们的各种复杂参数就让人云里雾里。如何选择一款最适合的相机,也许你该听听专家的意见。

成像技术的进步,以及配套工具的发展,正为我们呈现出一个五彩斑斓的生物学世界。如今,我们可以观察细胞网络,窥探细胞内部,并实时观察各种生物学过程。这一切,都离不开显微镜。

显微镜相机捕获了一个不为人知的微观世界,让我们对大自然的复杂精巧赞叹不已。目前市场上有许许多多的显微镜可供选择,单就相机而言,它们的各种复杂参数就让人云里雾里。如何选择一款最适合的相机,也许你该听听专家的意见。

专家认为:“第一个关键点是选择合适的光学组件,能够捕捉各种现象,然后是选择与之匹配的相机。如果物镜的光学分辨率低于你要观察的结构,那么任何相机都帮不上忙。”

通常人们会根据传感器的类型来选择相机。CMOS(互补金属氧化物半导体)和CCD(电荷耦合器件)是两种最常见的传感器。这两种传感器的光电转换原理相同,但是信号的读出过程不同。考虑到灵敏度、噪声和暗电流噪声等,人们总认为CCD会逐渐取代CMOS,而CMOS也被认为是一种经济的替代品。

不过,经过多年的发展,CMOS传感器似乎开始“咸鱼翻身”。据Andor公司显微镜产品专家Alan Mullan介绍,自2010年左右推出科学级CMOS(sCMOS)传感器以来,行间传输CCD传感器已不再那么受欢迎。他认为,sCMOS正取代CCD成为显微镜中的“全能王”。

我们也持有类似的观点。“目前,在高端显微镜中,sCMOS已成为最常用的解决方案。sCMOS的唯一缺点是缺乏长时间曝光的能力,因为它会对图像造成太大的噪声,”他说。CCD相机仍然是长时间曝光的首选。此外还有适用于最低光照条件的EMCCD(电子倍增CCD)。认为,EMCCD非常灵敏,可用来捕捉快速的生物现象。

如何选择相机?

根据传感器类型来选择相机是一种办法,但不是唯一的办法。Thorlabs Scientific Imaging公司的首席技术专家Ash Prabala认为,量子效率(QE)和读取噪声(Nr)是决定相机灵敏度的两个关键变量。因此,在选购时需要考虑信噪比(SNR)。

据Prabala介绍,在极低的光照条件(小于10个光子/像素)下,EMCCD提供最高的信噪比。随着光照水平的增加,sCMOS相机也是不错的选择,比如TPCO科学级CMOS相机。



Mullan认为:“相机列出了许多参数,而你很难确定哪些参数真正重要,以及它们对图像质量到底有没有影响。此外,一些关键的参数可能无法同时达到。”例如,调整读取噪声可能会影响速度。他认为最重要的三个参数是:灵敏度、分辨率和速度。

影响信噪比的因素——制冷与暗电流

由于暗电流(信噪比公式中的”D”)来源于材料中电子的热运动,所以芯片温度越高,暗电流越大;对于同一芯片,近似的规律是温度每下降10度,暗电流减小一半。

当前市场上的中高端科研相机的暗电流通常都很小,在1s以下曝光时间时,暗噪声相比于读出噪声通常可以忽略。但由于暗电流随曝光时间会积累,所以越是长曝光时间的应用,制冷就越重要。

在实际选型中,不同类型的相机对制冷的要求也不尽相同:

(1)对于EMCCD相机,像素尺寸通常较大(常见的为13-16μm),每个像素上产生的暗电流本就较多,而且EMCCD中的暗电流还会和信号一起被增益放大,所以用制冷压制EMCCD相机的暗电流产生尤其重要。因为这些原因,主流的EMCCD相机制冷温度都在-50℃以下。
(2)而对于sCMOS相机,不仅像素尺寸会较小一些(常见的为6.5μm),也没有额外的增益,所以对制冷的要求就相对低一点。

笔者在平时工作中,就曾经有过两个有趣的相关经历。第一个是刚接触科研相机时,看到许多诸如室温下10℃(-10℃ from ambient temperature)的相机,表示不可理解,觉得”就10度的制冷,这有啥用?”。第二个是滨松有一款面向产业客户的板级sCMOS相机C11440-62U,其制冷温度为室温上10℃(+10℃ from ambient temperature),刚看到参数的时候也是小小疑惑了一把。其实当年产生这样的疑惑,就是因为没有意识到如果相机没有制冷,实际的工作温度将远超室温这一点。
小结:对于当今的高端相机,只要有制冷,暗电流都很小。

影响信噪比的因素(6)——读出噪声(R)

在信号较弱的成像中,来自信号的散粒噪声较小;而暗电流的散粒噪声(即暗噪声)在当前的高端科研相机都是很低的,在曝光时间1s这个量级甚至更短的时候,暗噪声通常可以忽略;此时读出噪声(即信噪比公式中的”R”)就称为特别需要考量的因素了。

对于同样的芯片,读出噪声的大小与读出速度有关,无论对于CCD相机还是sCMOS相机,读出速度越快,读出噪声越高。而sCMOS相对于CCD的一个核心优势,就是高速读出时依然能够保持极低的读出噪声。

读出噪声的重要性也使得其和QE一起变成了相机被重点关注的两个参数。单纯考察两者中的一个优势并不能正确预测成像的信噪比。如图9所示,同样拍一个绿色荧光样品,QE较高的ORCA-Spark成像质量却不如ORCA-Flash 4.0 LT,就是因为ORCA-Flash 4.0 LT的读出噪声较低,综合考虑时ORCA-Flash 4.0 LT的信噪比更好。
小结:如果用于弱信号探测,相机的读出噪声对于总体的信噪比很重要。


另外,所有专家都提醒,如果没有用你自己的样品做过演示,千万不要买。这是确定哪款相机满足您需求的唯一方法。总是强调取舍,正所谓有得也有失。如果你现在无法确定相机的主要用途,那么可以选择全能型的sCMOS。

事实上,sCMOS总是被专家反复推荐。Mullan表示,无论是明场还是荧光成像,无论是单一还是混合成像,sCMOS也许都是最佳选择,比如PCO的Edge系列相机。

的终极建议是:任何高端相机都无法检测到低端显微镜所丢失的信息。从另一方面来说,若使用低端相机,那么搭配顶级物镜也没有意义。“平衡,这就是显微镜专家为帮助客户找到最佳解决方案而做的事情。”

五个考虑因素

sCMOS相机是如今的“全能型”相机。若需要在不同光照水平下使用显微镜,可考虑这个选项。记住,在极低光照条件下,EMCCD相机可能更适合。CCD相机仍然分为许多种,具体取决于您的参数。
对显微镜的相机而言,相机灵敏度可能是最重要的参数。共聚焦或光场显微镜等技术本身就是低光度,因此必须使用灵敏的相机。换句话说,明视场显微镜不需要同样的灵敏度。
灵敏度取决于信噪比(SNR),当然越高越好。为了获得最佳的信噪比,相机的量子效率(QE)要高,而读取噪声(Nr)要低。噪声取决于所需的曝光类型。
分辨率指的是相机可捕捉的细节量,取决于像素大小和视野。在较低的放大倍数下,较小的像素可提供较高的空间分辨率。不过,与较大的像素(如EMCCD相机)相比,信噪比会更低。关键是确定一种像素大小,既能提供足够的分辨率,又能提供良好的信噪比。
速度应当取决于捕获的现象。例如,钙成像就需要尽可能快的帧速率。相机必须足够灵敏,才能快速曝光。当速度是关键考虑因素时,sCMOS或EMCCD相机也许是合适的选择。